his.sePublications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Initiering av statistiska modeller för sekvensmodellering
University of Skövde.
1998 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor)Student thesis
Abstract [sv]

I detta arbete studeras möjligheten att förbättra en metod för analys av biologiska sekvenser. En på senare tid populär metod för sekvensanalys är baserad på Hidden Markov models (HMM). HMM har haft stora framgångar i att modellera biologisk data, såsom proteinfamiljer, men används även inom bland annat taligenkänning. Existerande problem med HMM är bland annat långa träningstider och oförmåga att finna globala lösningsoptima.

En metod för att försöka effektivisera träningsfasen hos en HMM presenteras och utvärderas. Denna är avsedd för att undersöka om modeller som på förhand kan initieras med hjälp av förkunskap i problemdomänen får lika bra klassificeringsförmåga som modeller som tränas på konventionellt sätt.

Metoden tillämpas på två proteinfamiljer av relativt olika karaktär. Resultaten utvisar att prestandan hos de olika modellerna inte direkt kan kopplas till effekten av metoden utan är mycket beroende av proteinets karaktär.

Place, publisher, year, edition, pages
1998. , 61 p.
National Category
Information Science
Identifiers
URN: urn:nbn:se:his:diva-154OAI: oai:DiVA.org:his-154DiVA: diva2:2502
Presentation
(English)
Uppsok
Social and Behavioural Science, Law
Supervisors
Available from: 2007-10-12 Created: 2007-10-12 Last updated: 2009-09-21

Open Access in DiVA

fulltext(255 kB)77 downloads
File information
File name FULLTEXT01.psFile size 255 kBChecksum MD5
a8860322258d55ead36919fb1ebeda7cac9fc62cc917c1981e244517140edc1bd09684f4
Type fulltextMimetype application/postscript
fulltext(255 kB)50 downloads
File information
File name FULLTEXT02.pdfFile size 255 kBChecksum SHA-512
091b76a6407241dec8b0a340a695081d291cd85be9147a8421e5c9c5962ce56d1f157f6bb108bd67aaeebab2bd64a979486d30d41db6aba1802f44b7ce232e80
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
University of Skövde
Information Science

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 127 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

Total: 115 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf