his.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Functional prediction of a T-DNA tagged gene of Arabidopsis thalianaby in silico analysis
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur.
Högskolan i Skövde, Institutionen för kommunikation och information.ORCID-id: 0000-0002-6549-086x
Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi. Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur.ORCID-id: 0000-0002-3053-4543
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur.
2004 (Engelska)Ingår i: Journal of Molecular Modeling, ISSN 1610-2940, E-ISSN 0948-5023, Vol. 10, nr 2, s. 130-138Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

We have employed a gene-knockout approach using T-DNA tagging and in vivo gene fusion in Arabidopsis thaliana for identification and isolation of specific plant genes. Screening of about 3,000 T-DNA tagged lines resulted in identification of a mutant line (no. 197) exhibiting a significant delay in flowering. From this line a 600-bp plant DNA fragment downstream of the left T-DNA junction was cloned by inverse PCR. BLAST searching in the A. thaliana genomic database indicated a putative gene, frf (flowering regulating factor), with unknown function downstream of the T-DNA insert. Bioinformatic tools were used to predict possible protein structure and function. The protein structure predicted by fold recognition indicates that frf is a transcriptional regulator, a ligand-binding receptor responsive to steroids and hormones. Analyzing the predicted results and the phenotype of the T-DNA tagged plant we hypothesized that FRF might be involved in hormone response in A. thaliana. For verification of this hypothesis we exposed the plants of line no. 197 to gibberellic acid (GA3), a potential growth regulator in higher plants. This treatment resulted in an earlier onset of flowering, almost similar to that in wild type control plants.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Springer , 2004. Vol. 10, nr 2, s. 130-138
Nationell ämneskategori
Botanik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:his:diva-2382DOI: 10.1007/s00894-003-0176-3OAI: oai:DiVA.org:his-2382DiVA, id: diva2:126873
Tillgänglig från: 2008-11-25 Skapad: 2008-11-25 Senast uppdaterad: 2020-01-29Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Svensson, MariaLundh, DanEjdebäck, MikaelMandal, Abul

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Svensson, MariaLundh, DanEjdebäck, MikaelMandal, Abul
Av organisationen
Institutionen för vård och naturInstitutionen för kommunikation och informationForskningscentrum för Systembiologi
I samma tidskrift
Journal of Molecular Modeling
Botanik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 1913 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf