his.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Genome Sequencing Revealed Chromium and Other Heavy Metal Resistance Genes in E. cloacae B2-Dha
Högskolan i Skövde, Institutionen för biovetenskap. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi. The Life Science Center, School of Science and Technology, Örebro University, SE-701 82 Örebro, Sweden. (Bioteknik, Biotechnology)ORCID-id: 0000-0002-8162-8945
Högskolan i Skövde, Institutionen för biovetenskap. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi. (Bioinformatik, Bioinformatics)ORCID-id: 0000-0001-6254-4335
The Life Science Center, School of Science and Technology, Örebro University, SE-701 82 Örebro, Sweden.
Microbial Diversity Research Centre, Dr. D.Y. Patil Biotechnology and Bioinformatics Institute, Dr. D. Y. Patil Vidyapeeth, Tathawade, Pune-411033, India.
Visa övriga samt affilieringar
2017 (Engelska)Ingår i: Journal of Microbial & Biochemical Technology, E-ISSN 1948-5948, Vol. 9, nr 5, s. 191-199Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The previously described chromium resistant bacterium, Enterobacter cloacae B2-DHA, was isolated from leather manufacturing tannery landfill in Bangladesh. Here we report the entire genome sequence of this bacterium containing chromium and other heavy metal resistance genes. The genome size and the number of genes, determined by massive parallel sequencing and comparative analysis with other known Enterobacter genomes, are predicted to be 4.22 Mb and 3958, respectively. Nearly 160 of these genes were found to be involved in binding, transport, and catabolism of ions as well as efflux of inorganic and organic compounds. Specifically, the presence of two chromium resistance genes, chrR and chrA was verified by polymerase chain reaction. The outcome of this research highlights the significance of this bacterium in bioremediation of chromium and other toxic metals from the contaminated sources.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Omics Publishing Group , 2017. Vol. 9, nr 5, s. 191-199
Nyckelord [en]
Genome Sequencing, Bioremediation, Toxic metals, Enterobacter cloacae, Gene annotation
Nationell ämneskategori
Bioinformatik och systembiologi
Forskningsämne
Bioteknik; Bioinformatik; INF501 Integrering av -omicsdata
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:his:diva-14401DOI: 10.4172/1948-5948.1000365OAI: oai:DiVA.org:his-14401DiVA, id: diva2:1156790
Tillgänglig från: 2017-11-14 Skapad: 2017-11-14 Senast uppdaterad: 2018-11-16Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(523 kB)91 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 523 kBChecksumma SHA-512
6e7010f8e8ae5ee4c4b4883591a17328e6d008ace1371cf175892fc1d2a2374c59448ab522b076010cad91af4060035a8f8008ea06238e123b16284238caa036
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Rahman, AminurOlsson, BjörnMandal, Abul

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Rahman, AminurOlsson, BjörnMandal, Abul
Av organisationen
Institutionen för biovetenskapForskningscentrum för Systembiologi
I samma tidskrift
Journal of Microbial & Biochemical Technology
Bioinformatik och systembiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 91 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 422 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf