his.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Validation of Suitable Endogenous Control Genes for Quantitative PCR Analysis of microRNA gene expression in a rat model of endometrial cancer
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi.
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi.
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi.
2013 (Engelska)Ingår i: Cancer Cell International, ISSN 1475-2867, E-ISSN 1475-2867, Vol. 13, artikel-id 45Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Background

MicroRNAs are small RNA molecules that negatively regulate gene expression by translational inhibition or mRNA cleavage. The discovery that abnormal expression of particular miRNAs contributes to human disease, including cancer, has spurred growing interest in analysing expression profiles of these molecules. Quantitative polymerase chain reaction is frequently used for quantification of miRNA expression due to its sensitivity and specificity. To minimize experimental error in this system an appropriate endogenous control gene must be chosen. An ideal endogenous control gene should be expressed at a constant level across all samples and its expression stability should be unaffected by the experimental procedure.

Results

The expression and validation of candidate control genes (4.5S RNA(H) A, Y1, 4.5S RNA(H) B, snoRNA, U87 and U6) was examined in 21 rat cell lines to establish the most suitable endogenous control for miRNA analysis in a rat model of cancer. The stability of these genes was analysed using geNorm and NormFinder algorithms. U87 and snoRNA were identified as the most stable control genes, while Y1 was least stable.

Conclusion

This study identified the control gene that is most suitable for normalizing the miRNA expression data in rat. That reference gene will be useful when miRNAs expression are analyzed in order to find new miRNA markers for endometrial cancer in rat.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
BioMed Central, 2013. Vol. 13, artikel-id 45
Nyckelord [en]
Endogenous control genes, microRNA, Endometrial cancer
Nationell ämneskategori
Naturvetenskap
Forskningsämne
Naturvetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:his:diva-8384DOI: 10.1186/1475-2867-13-45ISI: 000319504800001PubMedID: 23680393Scopus ID: 2-s2.0-84878248686OAI: oai:DiVA.org:his-8384DiVA, id: diva2:640057
Tillgänglig från: 2013-08-12 Skapad: 2013-08-09 Senast uppdaterad: 2017-12-06Bibliografiskt granskad
Ingår i avhandling
1. MicroRNA expression profiling in endometrial adenocarcinoma
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>MicroRNA expression profiling in endometrial adenocarcinoma
2015 (Engelska)Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Örebro: Örebro university, 2015. s. 53
Serie
Örebro Studies in Medicine, ISSN 1652-4063 ; 118
Nyckelord
Endometrial cancer, microRNA, BDII rat model, normalization, endogenous controls
Nationell ämneskategori
Cancer och onkologi
Forskningsämne
Medicin
Identifikatorer
urn:nbn:se:his:diva-10886 (URN)9789175290638 (ISBN)
Disputation
2015-03-27, Portalen, Högskolan i Skövde, Högskolevägen, 09:00 (Engelska)
Opponent
Handledare
Tillgänglig från: 2015-05-04 Skapad: 2015-05-04 Senast uppdaterad: 2017-11-27Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Validation of Suitable Endogenous Control Genes for Quantitative PCR Analysis of microRNA gene expression in a rat model of endometrial cancer(224 kB)441 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 224 kBChecksumma SHA-512
54b49ce5289c03569c6bff601807de8573bfb53dea8f3d0f2bc4114ac22dc0a1be73f1589edfb8c36c959adaf41e1fba01b130fe983ace884425867110885b4a
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopusLänk till fulltext

Personposter BETA

Jurcevic, SanjaOlsson, BjörnKlinga-Levan, Karin

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Jurcevic, SanjaOlsson, BjörnKlinga-Levan, Karin
Av organisationen
Institutionen för vård och naturForskningscentrum för Systembiologi
I samma tidskrift
Cancer Cell International
Naturvetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 441 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 1218 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf