his.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Deriving Genetic Networks from Gene Expression Data and Prior Knowledge
Högskolan i Skövde, Institutionen för datavetenskap.
2001 (Engelska)Självständigt arbete på avancerad nivå (magisterexamen)Studentuppsats
Abstract [en]

In this work three different approaches for deriving genetic association networks were tested. The three approaches were Pearson correlation, an algorithm based on the Boolean network approach and prior knowledge. Pearson correlation and the algorithm based on the Boolean network approach derived associations from gene expression data. In the third approach, prior knowledge from a known genetic network of a related organism was used to derive associations for the target organism, by using homolog matching and mapping the known genetic network to the related organism. The results indicate that the Pearson correlation approach gave the best results, but the prior knowledge approach seems to be the one most worth pursuing

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Skövde: Institutionen för datavetenskap , 2001. , s. 86
Nyckelord [en]
Genetic networks, Homology, Gene expression data, Correlation measurement, Boolean network
Nationell ämneskategori
Bioinformatik och systembiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:his:diva-589OAI: oai:DiVA.org:his-589DiVA, id: diva2:2976
Presentation
(Engelska)
Uppsök
bio-/geovetenskap
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2008-01-25 Skapad: 2008-01-25 Senast uppdaterad: 2009-11-18

Open Access i DiVA

fulltext(5047 kB)198 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.psFilstorlek 5047 kBChecksumma SHA-1
dfd52c95abe5e30db897e3364daab2b4093e59613c126f104e73ed06885a2f2d41faf660
Typ fulltextMimetyp application/postscript
fulltext(865 kB)207 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 865 kBChecksumma SHA-512
0b9878eb5240d6166fe3d9410ff32890411a30463f74440f2dfe5c4f65149ee7e20679a91002116bf123042f7fce49fde6ada47cd62cc6d21095c61415736963
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Av organisationen
Institutionen för datavetenskap
Bioinformatik och systembiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 405 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 227 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf