his.sePublikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Validation of Suitable Endogenous Control Genes for Quantitative PCR Analysis of microRNA gene expression in a rat model of endometrial cancer
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi.
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi.
Högskolan i Skövde, Institutionen för vård och natur. Högskolan i Skövde, Forskningscentrum för Systembiologi.
2013 (engelsk)Inngår i: Cancer Cell International, ISSN 1475-2867, E-ISSN 1475-2867, Vol. 13, artikkel-id 45Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
Abstract [en]

Background

MicroRNAs are small RNA molecules that negatively regulate gene expression by translational inhibition or mRNA cleavage. The discovery that abnormal expression of particular miRNAs contributes to human disease, including cancer, has spurred growing interest in analysing expression profiles of these molecules. Quantitative polymerase chain reaction is frequently used for quantification of miRNA expression due to its sensitivity and specificity. To minimize experimental error in this system an appropriate endogenous control gene must be chosen. An ideal endogenous control gene should be expressed at a constant level across all samples and its expression stability should be unaffected by the experimental procedure.

Results

The expression and validation of candidate control genes (4.5S RNA(H) A, Y1, 4.5S RNA(H) B, snoRNA, U87 and U6) was examined in 21 rat cell lines to establish the most suitable endogenous control for miRNA analysis in a rat model of cancer. The stability of these genes was analysed using geNorm and NormFinder algorithms. U87 and snoRNA were identified as the most stable control genes, while Y1 was least stable.

Conclusion

This study identified the control gene that is most suitable for normalizing the miRNA expression data in rat. That reference gene will be useful when miRNAs expression are analyzed in order to find new miRNA markers for endometrial cancer in rat.

sted, utgiver, år, opplag, sider
BioMed Central, 2013. Vol. 13, artikkel-id 45
Emneord [en]
Endogenous control genes, microRNA, Endometrial cancer
HSV kategori
Forskningsprogram
Naturvetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:his:diva-8384DOI: 10.1186/1475-2867-13-45ISI: 000319504800001PubMedID: 23680393Scopus ID: 2-s2.0-84878248686OAI: oai:DiVA.org:his-8384DiVA, id: diva2:640057
Tilgjengelig fra: 2013-08-12 Laget: 2013-08-09 Sist oppdatert: 2017-12-06bibliografisk kontrollert
Inngår i avhandling
1. MicroRNA expression profiling in endometrial adenocarcinoma
Åpne denne publikasjonen i ny fane eller vindu >>MicroRNA expression profiling in endometrial adenocarcinoma
2015 (engelsk)Doktoravhandling, med artikler (Annet vitenskapelig)
sted, utgiver, år, opplag, sider
Örebro: Örebro university, 2015. s. 53
Serie
Örebro Studies in Medicine, ISSN 1652-4063 ; 118
Emneord
Endometrial cancer, microRNA, BDII rat model, normalization, endogenous controls
HSV kategori
Forskningsprogram
Medicin
Identifikatorer
urn:nbn:se:his:diva-10886 (URN)9789175290638 (ISBN)
Disputas
2015-03-27, Portalen, Högskolan i Skövde, Högskolevägen, 09:00 (engelsk)
Opponent
Veileder
Tilgjengelig fra: 2015-05-04 Laget: 2015-05-04 Sist oppdatert: 2017-11-27bibliografisk kontrollert

Open Access i DiVA

Validation of Suitable Endogenous Control Genes for Quantitative PCR Analysis of microRNA gene expression in a rat model of endometrial cancer(224 kB)441 nedlastinger
Filinformasjon
Fil FULLTEXT01.pdfFilstørrelse 224 kBChecksum SHA-512
54b49ce5289c03569c6bff601807de8573bfb53dea8f3d0f2bc4114ac22dc0a1be73f1589edfb8c36c959adaf41e1fba01b130fe983ace884425867110885b4a
Type fulltextMimetype application/pdf

Andre lenker

Forlagets fulltekstPubMedScopusLänk till fulltext

Personposter BETA

Jurcevic, SanjaOlsson, BjörnKlinga-Levan, Karin

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Jurcevic, SanjaOlsson, BjörnKlinga-Levan, Karin
Av organisasjonen
I samme tidsskrift
Cancer Cell International

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 441 nedlastinger
Antall nedlastinger er summen av alle nedlastinger av alle fulltekster. Det kan for eksempel være tidligere versjoner som er ikke lenger tilgjengelige

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetric

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 1220 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf